醫(yī)學(xué)院的科系和研究所通常分為臨床醫(yī)學(xué)和基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)。臨床醫(yī)學(xué)部門培養(yǎng)與維護人類生命安全直接相關(guān)的職業(yè)人才，包括醫(yī)學(xué)系、藥學(xué)系、護理系和醫(yī)技系。這些部門的目標(biāo)是培養(yǎng)醫(yī)生、藥師、護士、醫(yī)檢師、康復(fù)師等專業(yè)人員。在某些大學(xué)中，藥學(xué)系有時會單獨成立為藥學(xué)院。

基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)部分主要致力于培養(yǎng)醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的研究人才，研究方向涵蓋解剖學(xué)、病理學(xué)、微生物學(xué)、分子生物學(xué)、生物化學(xué)、藥理學(xué)、法醫(yī)學(xué)和放射醫(yī)學(xué)等領(lǐng)域。醫(yī)學(xué)院的院長通常由具備醫(yī)師資格的教授擔(dān)任。