在上海飛往日本各大城市的航班都有。首先是位于關東平原南端、東京灣西北岸的東京，作為日本的首都，人口約840萬，包括郊區人口超過1189萬，是政治、經濟和文化中心。東京工業最為發達，以印刷、橡膠制品、皮革制品和精密儀器為主，大部分對外貿易通過橫濱進行。

其次是大阪，是日本第二大城市，人口約264萬。再往南一點是名古屋，人口約209萬，工業發達，年產值僅次于東京和大阪，毛紡織和陶瓷工業居全國首位。

橫濱是另一個重要的城市，人口約277萬，是日本最大的海港之一，也是東京的外港，其對外貿易額約占全國1/4。同時，對于留學生來說，橫濱也是一個重要的留學地點。

京都是一座有著148萬人口的歷史悠久的城市，曾經是日本的故都，也是一個著名的文化、旅游和工業城市。京都以絲織品、藝術陶瓷器以及其他手工藝品而聞名，是一個體現日本傳統風情的旅游勝地。

最后是神戶，人口約136萬，也是日本最大的海港之一，作為大阪的外港，扮演著重要的貿易角色。