轉錄組測序是一種新興的技術，利用新一代測序技術對轉錄組進行分析。它可以快速地獲取特定細胞或組織在某一狀態下幾乎所有轉錄本的序列信息和表達水平。這些轉錄本不僅包括編碼蛋白質的mRNA，還包括各種非編碼RNA以及基因選擇性剪接產生的不同轉錄本。通過轉錄組測序，我們不僅可以分析轉錄本的結構和表達水平，還可以發現未知轉錄本和稀有轉錄本，從而準確地研究基因表達差異、基因結構變異，并篩選出分子標記等生命科學中的重要問題。轉錄組測序的研究對象主要是特定細胞在某一功能狀態下產生的所有RNA，其中包括mRNA和非編碼RNA。轉錄組研究是進行基因功能和結構研究的基礎和起點。通過新一代高通量測序技術，我們可以全面快速地獲取某一物種特定組織或器官在某一狀態下的幾乎所有轉錄本的序列信息。這項技術已經廣泛地應用于基礎研究、臨床診斷和藥物研發等領域。