站在這里等你三千年的歌詞含義是陪伴守望著孤墳，度過孤獨的一生。王琪作為歌曲的作者，以胡楊林和雁的傳說為基礎，創造了一對虛擬的男女主角。這對戀人分別生活在梅里雪山兩側的草原上，他們發誓海枯石爛，永不分離。然而，女主角患上了無法治愈的疾病，她覺得應該讓男主角放棄她，并與父母商量好，以一種善意的謊言欺騙男主角，告訴他她會另愛他人并遠嫁異鄉，并告知了出嫁的日期。女主角穿上嫁衣，在父母的扶持下含淚走上花轎，她在花轎中看著男主角漸行漸遠，情不自禁地流淚呼喊著“不要等我了”。當走到男主角看不見的地方時，女主角下了花轎，心痛欲絕……不久，女主角在痛苦中離世。男主角一直在思念中等待著，直到六年后才得知真相，他來到女主角的墳前，哭泣并發誓，生也愿意等你，死也愿意等你，愿意像胡楊一樣等待三千年，為了不讓女主角孤獨，他將陪伴守望著她的孤墳，度過孤獨的一生。