鋼鐵俠3之后是復仇者聯盟2。在鋼鐵俠3中，Mark 8到Mark 42的裝甲都被炸毀了，而復聯2的開場則是Mark 43。雖然外觀上只是顏色上的變化，但后續電影接上的是Mark 43。

鋼鐵俠3最后的彩蛋是斯塔克躺在躺椅上，與綠巨人談論自己的經歷。然而綠巨人早就睡著了，斯塔克感到無奈，綠巨人告訴他自己又并非心理醫生。鋼鐵俠3的彩蛋實際上與后續電影情節無關，只是為了創造一種親密友誼的氛圍。