雪松是一種少見的開花植物，開花時間通常在10-11月份。它的花朵數量較少且不明顯，沒有花瓣存在，因此很多人認為它不會開花。雪松的花朵通常開在新枝條的基部位置，形狀呈黃色小球狀。輕輕觸摸枝條時，會有黃色花粉飄落下來，并有淡淡的松香氣味。

雪松的花朵可分為兩種，即雌花和雄花。雌花呈手指狀，淡紫色，上面有分布著一些盤旋的珠狀結構，背面有許多短小的苞片。在授粉后，雌花會變成小球狀，并在第二年春天繼續生長，形成松球并結出可食用的松子。雄花一開始就呈小球狀，花絲很短，中間有兩個花藥，邊緣有細齒分布。