這種液體呈黃色澄清透明，氣味溫和獨特，結構穩定且無腐蝕性。脂肪酸甲酯是廣泛使用的表面活性劑的原料之一。全球脂肪醇57%的產量來自于脂肪酸甲酯。利用脂肪酸甲酯可以生產兩類表面活性劑，一種是通過磺化中和制備脂肪酸甲酯磺酸鹽，另一種是通過氫化制備脂肪醇。