只有三種元素能夠形成氫鍵，它們分別是氮、氧和氟。當它們與氫原子直接相連時，形成的基團例如-OH、-COOH、-NH2、HF、水分子和氨都具有氫鍵。然而，這些元素的氣態狀態下并不具備氫鍵。分子間氫鍵形成的條件有：首先，原子A需要具有高電負性才能與氫原子形成氫鍵；其次，原子B的部分負電荷半徑較小且電負性較大，這樣才能產生靜電引力，其中B通常是氟、氧或氮；最后，氫鍵的結合可以用通式表示。而分子內氫鍵形成的條件則受到環結構和X－H、Y的影響，這兩者往往不能在同一直線上。分子內氫鍵的存在能夠降低物質的熔點。同時，分子內氫鍵必須滿足形成氫鍵的基本條件，并且形成的環必須是平面的，五或六原子環是最穩定的選擇，并且這些環中不能出現任何扭曲。