轉(zhuǎn)錄組分析是指在某一生理功能狀態(tài)下，某個物種或特定細(xì)胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄的mRNA產(chǎn)物的集合。這些轉(zhuǎn)錄物的集合包含了時間和空間的限定，是連接基因組遺傳信息與蛋白質(zhì)組生物功能的紐帶。目前，轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控是最廣泛研究的調(diào)控方式，也是生物體中最為重要的調(diào)控方式之一。通過應(yīng)用高通量技術(shù)進行轉(zhuǎn)錄組測序，可以快速而可靠地獲取轉(zhuǎn)錄組的信息。轉(zhuǎn)錄本表達分析可以通過獲得研究對象基因組轉(zhuǎn)錄區(qū)域的信息，識別轉(zhuǎn)錄發(fā)生的位點和可變剪切等，而其精確的計數(shù)方法更可對基因進行精確的定量分析。